MiniBLAST_Hashmap/input_medium.txt at main · Averkleeren/MiniBLAST_Hashmap · GitHub

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genome genome_medium.txt
table_size 50
occupancy 0.65
kmer 3
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query 0 AGGTGTATAAGGGATGTAATTAAAATTCAGAGCATCTGTCCTAGGCCTCCTTGCTTTCCTGTTCTCTCTCCCACCACACTGCCAGGTCACATT
query 5 TACAGATTGCTGATTTAATTAAGGTCTTCTGTCTTAGTCAGCAAGTTTAGTCTGTGGTACTTG
query 0 ACACTTCCAGCAGAGCAATTGATTCCCTGGCTCTCCCCACCTCACCAGCCCACTCCTCCTAAAGGGCTT
query 2 AGCAGAAACTCAGGATGTCGAGTCTCCAGCCAGATCCCAACCATGTCTCCACCACTGCCCAGCGTGTGAACCTTGAA
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query 5 TAAGTGGGGCCCTGAGAAAGGATGTAGAACAG
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query 4 TAGTGTTCGGAGACCTGTATTATAAACAAGTTTTCTGGAGAATTCTGGAGCAGGTCCTCCACAAAC
query 5 AGTGCTCCACAAATAGCGGGTATAATATTTTATCATCCCTGCCCACAAAAATGGTCATAACACCCTCCCCGGTTGGAG
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query 3 CCACACTGTCTTCCACAAGGGTAGAAC
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query 0 CCAAGGATATTCCGTAGTCAGTGGTGAGGCTGCTATTTGAAACCAGGTGGGTCTGTCT
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query 5 ATGTGTGTGTGTGCATGTGTGTAT
query 0 TCTCTGTTTGTCCGTTAATGGTGTATATGAATGCTAGTGATTTTTGCACATTCATTTTGTATC
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query 4 CTATGAACCAGGAAGCAGGTCACTGTGCACTCAATCTCCCAACACCTTGA
query 3 AGCAGGCTTTGAATCCAGCAGACAGGCTTAGAGTCCGTGCCCTTCACCCTGCTTCTGTCTGCCTCTTGTTCATGTTAATTTATGT
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query 4 AAGAGATCTCATTGGTAGTGGGCCTGCCTAGCCCTACTTAATTTTCATCCAC
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query 2 GAGGGAGATTGAGATGGGGTGGAGCTGATTAGGGATGGCTGCCTGGCAGAGGTGGTATTTGAGCTGGGCTTGATGGCTGAGTGCGAGTTGGATGTAAAGA
query 4 ACAAAGAGAGCCAAATATATTTCAGAAACACAAATATGTTCATTTAACTAGTTGAACTAAAGCTAGATACTGTCGCACAAA
query 5 CCCTTGGAGATGGGGCCTCTCGCATGGAGGTTGTC
quit